История музея ведется с 1709 года, когда по распоряжению Петра I была основана Модель-камера (от нидерл. model - kammer - комната моделей, кладовая образцов), где хранились корабельные чертежи и модели. Были приняты законодательные меры по систематическому пополнению коллекции.